Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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SQSTM1Q13501 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SQSTM1Q13501 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SQSTM1Q13501 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SQSTM1Q13501 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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