Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXD4Q12950 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXD4Q12950 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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