Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SNX13Q9Y5W8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
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SNX13Q9Y5W8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SNX13Q9Y5W8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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SNX13Q9Y5W8 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNX13Q9Y5W8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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SNX13Q9Y5W8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SNX13Q9Y5W8 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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