Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NRF1Q16656 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NRF1Q16656 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.8 ms