Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDB1Q16531 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
DDB1Q16531 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.9 ms