Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SSPNQ14714 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.1 ms