Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
COL9A2Q14055 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
COL9A2Q14055 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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