Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SQSTM1Q13501 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SQSTM1Q13501 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SQSTM1Q13501 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SQSTM1Q13501 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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