Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRAF3Q13114 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRAF3Q13114 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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TRAF3Q13114 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TRAF3Q13114 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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