Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRIM63Q969Q1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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