Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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CCDC74AQ96AQ1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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CCDC74AQ96AQ1 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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CCDC74AQ96AQ1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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CCDC74AQ96AQ1 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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CCDC74AQ96AQ1 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC74AQ96AQ1 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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