Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
COL9A2Q14055 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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