Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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GRIK3Q13003 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK3Q13003 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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