Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
COL9A2Q14055 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
COL9A2Q14055 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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