Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms