Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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