Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.2 ms