Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNX13Q9Y5W8 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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SNX13Q9Y5W8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNX13Q9Y5W8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX13Q9Y5W8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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