Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166 ms