Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SQSTM1Q13501 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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