Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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