Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTPN13Q12923 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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