Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
BBS9Q3SYG4 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BBS9Q3SYG4 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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