Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
ZIC1Q15915 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
ZIC1Q15915 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
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