Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KLF9Q13886 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KLF9Q13886 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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