Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SQSTM1Q13501 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SQSTM1Q13501 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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