Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
GRIK3Q13003 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK3Q13003 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.1 ms