Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt71Q9R0H5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms