Protein–RNA interactions for Protein: Q58Y74

Trcg1, Taste receptor cell protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trcg1Q58Y74 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trcg1Q58Y74 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trcg1Q58Y74 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms