Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SNX13Q9Y5W8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNX13Q9Y5W8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNX13Q9Y5W8 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNX13Q9Y5W8 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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