Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
PXDC1Q5TGL8 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PXDC1Q5TGL8 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.2 ms