Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTPRTO14522 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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