Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MMS19Q96T76 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MMS19Q96T76 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms