Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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