Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD4Q12950 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXD4Q12950 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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FOXD4Q12950 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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FOXD4Q12950 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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FOXD4Q12950 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD4Q12950 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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