Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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SQSTM1Q13501 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SQSTM1Q13501 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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