Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD12P35452 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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