Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDX39BQ13838 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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