Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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CCL3L1P16619 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
CCL3L1P16619 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCL3L1P16619 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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