Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPRTO14522 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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