Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXD4Q12950 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD4Q12950 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.5 ms