Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A2Q14055 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A2Q14055 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272 ms