Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RDH8Q9NYR8 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.4 ms