Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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DDB1Q16531 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
DDB1Q16531 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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