Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPN13Q12923 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms