Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ssxb10Q6XAR7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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