Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TM6SF1Q9BZW5 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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