Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PTPN13Q12923 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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PTPN13Q12923 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPN13Q12923 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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