Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXD4Q12950 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXD4Q12950 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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