Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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GRIK3Q13003 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIK3Q13003 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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